Muhammad Ilyas adalah Menteri Agama pada 1955-1959 di beberapa kabinet pada masa pemerintahan Soekarno. Ia juga pernah menjabat sebagai Duta Besar Indonesia untuk Arab Saudi selama 6 tahun, sejak tahun 1959. KH Muhammad Ilyas adalah mertua dari Muhammad Maftuh Basyuni, Menteri Agama pada Kabinet Indonesia Bersatu 2004-2009.