Gereja Katolik di Jepang adalah bagian dari Gereja Katolik sedunia, di bawah pimpinan rohani Sri Paus dan Kuria di Roma. Diperkirakan terdapat 509.000 jiwa umat Katolik di Jepang - di bawah 0,5% dari keseluruhan populasi. Ada 16 keuskupan, termasuk 3 keuskupan agung dengan 1.589 imam dan 848 paroki di seluruh Jepang. Para uskup Jepang membentuk Konferensi Waligereja Katolik Jepang, Konferensi waligereja negara itu.